En l'absence d'oxygène, certaines bactéries dégradent la matière organique et produisent du biogaz dont un des composés est le méthane.

Cette réaction se trouve à l'état naturel dans plusieurs milieux :

- au fond des marais où les végétaux se décomposent lentement et produisent le "gaz des marais",

- dans les cimetières, où le méthane issu de la décompostion des corps provoque les "feux follets",

- dans les tas de fumiers,

- dans les décharges,

- dans les systèmes digestifs de la plupart des mammifères (d'où la production de biogaz),

- etc.

Dans ce cas, le biogaz libéré n'est en général pas récupéré (certaines décharges sont maintentant équipées), et le méthane participe à l'effet de serre : voir page sur le méthane. 
 

Cette réaction est fonction de la température. En effet, la température va influencer la vitesse à laquelle les bactéries agissent.  

Il existe trois domaines de températures distincts :

- la thermophilie :    la réaction est très rapide entre 45 et 70°C avec un optimum aux alentours de 60°C

- la mésophilie :       la réaction est rapide entre 20 et 45°C avec un optimum aux alentours de 37°C

- la psychrophilie :   la réaction est plus lente entre 0 et 20°C   avec un optimum aux alentours de 17°C

Je ne dispose pas de données sur la psychrophilie, ni sur des températures plus élevées pour la thermophilie.

La réaction mésophile est à l'oeuvre dans les systèmes digestifs de la plupart des mammifères.  

On trouve la réaction psychrophile à l'état naturel dans les marais, les cimetières et les décharges.